A Biblioteca iniciou suas atividades juntamente com a fundação da Faculdade de Medicina do Triângulo Mineiro, através do Decreto nº 35.249, de 24 de março de 1954. Inicialmente, funcionou numa sala, na então sede da FMTM, a Praça Manoel Terra, que com a expansão da Instituição, passou a ser o Campus I.

Em 1981, foi concluída a sede própria, com uma área construída de 1.372 m², e passou a ser denominada Biblioteca Frei Eugênio, em homenagem ao frade capuchinho Frei Eugênio Maria de Gênova.

Em 2009, com uma área de 2.408 m² foi concluído o projeto de ampliação e modernização da Biblioteca, para melhor atender a toda comunidade da UFTM.

O acervo da Biblioteca é constituído de livros, teses, monografias, periódicos, obras de referência, além de revistas eletrônicas e bases de dados.   

A consulta ao acervo está disponível aqui.